Chercheur.e modélisation de la dynamique de population du maigre (H/F)

L'unité mixte de recherche (UMR) Dynamique et durabilité des écosystèmes : de la source à l'océan (DECOD) regroupe des chercheurs, ingénieurs et techniciens de l'Ifremer, de l'Inrae et de l'Institut Agro Rennes-Angers avec des laboratoires à Brest, Lorient, Nantes et Rennes. Les activités de DECOD portent sur l'analyse des processus écologiques et évolutifs à l'œuvre dans les milieux aquatiques et leurs interfaces, de la source à l'océan, sur l'évaluation de l'état des écosystèmes et sur la construction de scénarios pour ces écosystèmes. Pour répondre à ces questions, le Laboratoire Ecologie et Modèle (EMH) acquiert des connaissances sur les écosystèmes marins et les activités anthropiques et met en œuvre des modèles et des approches quantitatives sur la base de données empiriques, dans un contexte d'approche écosystémique des pêches.Dans le cadre du projet ACOST (Amélioration de la COnnaissance sur des STocks du golfe de Gascogne : Lieu jaune, Maigre, Merlan et Rouget-barbet), ce post doctorat développera un modèle de dynamique de populations pour le maigre en utilisant diverses données. Mission principale :Estimer l'abondance du maigre du golfe de Gascogne par modélisation de données biologiques, halieutiques et génétiques.Activités principales :-Réaliser une étude de simulation en vue de l'utilisation de données génétiques (approche close-kin mark-recapture) pour le maigre du golfe de Gascogne (R packages CKMRpop et CKMRsim)-Préparation des données de génotypage (SNP) sur la base de critères de qualité-Identification des individus apparentés (R packages kinference et/ou Colony)-Développement d'un modèle de dynamique de population en utilisation toutes les données disponible (R package TMB)-Contribution au reporting du projet ACOST, rédaction de publication(s) et présentation des résultats