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Forme de travailImmunologue bio-informaticien Vos missions : Vous contribuerez au développement de vaccins au sein du groupe de développement bio-informatique (BFX). Vous participerez à la sélection des outils, validerez et participerez aux développements internes. Vous analyserez les données génomiques et immunologiques à l'aide d'outils informatiques et, le cas échéant, de méthodes d'intelligence artificielle. Vous interagirez quotidiennement avec des collaborateurs externes et avec les scientifiques du laboratoire Ceva, afin de comprendre les subtilités de la virologie/bactériologie moléculaire et la réponse immunitaire de l'hôte à la vaccination, à l'infection. Vos tâches quotidiennes impliqueront des pipelines bio-informatiques à l'aide d'outils commerciaux ou open source et/ou d'outils bio-informatiques personnalisés. Nous cherchons à soutenir des scientifiques passionnés, motivés et dotés d'une vision claire pour entreprendre des idées de recherche à haut risque et faire avancer le domaine de la bio-informatique, de la virologie/bactériologie et de l'immunologie. Nous sommes ouverts aux candidats possédant une expertise dans le domaine de la biologie computationnelle, à condition qu'elle soit associée à des connaissances/expériences en biologie moléculaire ou en immunologie animale ou humaine. Une expérience de la programmation est requise. Une expérience avancée du codage au niveau des algorithmes n'est pas nécessaire, mais le candidat retenu doit être disposé à apprendre/enseigner et à converser avec des scientifiques orientés vers la science des données. La collaboration avec des scientifiques débutants et leur encadrement sont attendus. Responsabilités et tâches principales : Bio-informatique Construire et améliorer les pipelines bio-informatiques pour la conception de vaccins ; Sélectionner et utiliser les outils bio-informatiques actuels et le pipeline pour l'analyse des données moléculaires et immunologiques ; Former les collègues aux approches bio-informatiques ; Concevoir, mettre en œuvre et maintenir les données de séquences des pathogènes ainsi que la réponse immunitaire de l'hôte, leurs métadonnées, et aussi les processus et solutions associés . Programmation Écrire du code et des scripts, concevoir des algorithmes et des pipelines ; Maîtrise d'au moins un langage informatique - Python (de préférence), R ou JavaScript. Compétences comportementales : · Elabore des solutions à partir de la complexité - Est ouvert et curieux des points de vue des autres ; · Collaborer avec empathie - A une attitude positive à l'égard de la collaboration ; · Engager et développer - Clarifier les orientations à court terme ; · Faire preuve d'ambition et de responsabilité - Gérer de manière proactive son propre travail et celui des autres ; · Orientation client - A pour objectif la satisfaction du client ; · Influencer les autres - Communiquer de manière transparente. Compétences techniques : Principes avancés d'immunologie et de biologie moléculaire ; Connaissance fonctionnelle des maladies infectieuses animales ; Connaissance de base de machine learning (shallow ou deep) ; Compétences informatiques souhaitées : * Langages informatiques - Python (de préférence), R ou JavaScript, * Analyses bio-informatiques à l'aide de codes accessibles au public ou de programmes commerciaux, * l'analyse des données dans ces langages informatiques, * Manipulation des bases de données et bonnes pratiques, * Automatisation avec des outils de CI, Snakemake ou Nextflow ; * Bonne capacité de communication - à la fois écrite et orale. Formation Doctorat en biologie : Immunologie, virologie, biologie moléculaire, bio-informatique ou informatique ou dans un domaine comparable ou apparenté. Expérience post-doctorale de préférence. Expérience professionnelle Plus de 5 ans en bio-informatique ou en immunologie (les diplômes supérieurs et l'expérience post-doctorale peuvent être pris en compte dans l'expérience professionnelle). Déplacements nécessaires : Ce poste peut être occupé à distance et nécessite des déplacements professionnels occasionnels.
